肿瘤分子靶向治疗的预后取决于多个因素，包括肿瘤的类型、分子靶向药物的选择、患者的基因变异、治疗反应等。
首先，不同类型的肿瘤对于分子靶向治疗的敏感性是不同的。一些特定基因突变或过表达在某些肿瘤类型中较为常见，而在其他肿瘤类型中较为罕见，因此只有对于某种肿瘤类型靶向治疗才会取得较好的预后效果。
其次，分子靶向药物的选择也对治疗预后有着重要影响。一些分子靶向药物已经证实对特定肿瘤具有较好的治疗效果，如HER2阴性乳腺癌患者可使用曲妥珠单抗治疗，EGFR突变的非小细胞肺癌患者可使用吉非替尼进行治疗。而对于没有选对靶向药物的患者，治疗效果则会大打折扣，预后也相对较差。
此外，患者的基因变异也会影响肿瘤分子靶向治疗的预后。某些基因突变会导致肿瘤对特定靶向药物产生耐药性，从而降低治疗效果。因此，了解患者的基因变异情况，可以帮助医生选择合适的分子靶向药物，提高治疗预后。
最后，治疗反应也是影响预后的重要因素。肿瘤分子靶向治疗通常需要持续使用一段时间才能看到疗效，因此，患者需要耐心等待并依从医生的治疗计划。治疗反应越好，预后越好。
总体而言，肿瘤分子靶向治疗预后的好坏取决于多个因素的综合作用。
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