穿刺检查是在相应的医学仪器的帮助下，抽取人体的血液、组织液或人体的部分组织进行活检。这类活检主要运用于对人体很多疾病的，精确的病理诊断。比如常见的穿刺检查，检查脑脊液，此类疾病主要是诊断脑部不明疾病的最终的检查，也是最有效的检查。
此外检查常见的实体脏器，比如肺叶。肺叶如果有不明包块，通过辅助影像学不能检查，就可以进行穿刺检查，以此确定病理组织的改变。还有如常见的肝脏、脾脏、胰腺，甚至腹腔里的腹膜后组织，还有空腔脏器的检查、泌尿系统器官的穿刺检查，如肾脏的穿刺活检。
有部分较特殊的穿刺检查，如在胃镜或结直肠镜帮助下，在镜下做活检组织的检查，其实是特殊的穿刺检查。
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