目前子宫肌瘤的确切的病因尚不明确。
因为肌瘤好发于生育期，青春期前少见，绝经后萎缩或消退，提示其发生可能与女性激素有关。有研究证明，肌瘤中雌激素受体浓度明显高于周边肌组织，故认为肌瘤组织局部对雌激素的高敏感性，是肌瘤发生的重要因素之一。所以目前比较公认的是子宫肌瘤是四种雌激素相关的肿瘤之一。同时，也有研究证实孕激素有刺激肌瘤生长的作用。
此外，遗传学研究显示，25%-50%的子宫肌瘤存在细胞遗传学异常，所以子宫肌瘤可能在某种程度也有遗传的倾向。
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