绝大部分食管肿瘤是恶性的，约90%以上食管肿瘤都是恶性的。
如果做胃镜检查时，发现食管黏膜是光滑的、完整的，而在其他检查中发现了食管上的占位病变，这种病变有可能不是来自于食管的上皮黏膜，而是来自食管肌层的病变。最为常见的是食管平滑肌瘤，这是一种良性疾病，更为少见的食管肿瘤包括食管肉瘤等食管其他一些罕见的肿瘤。
总体来说，食管病变90%以上都是食管癌，包括食管的鳞癌和下段食管的腺癌，其次是食管平滑肌瘤，更少见的是肉瘤。
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