肝穿刺活检主要适用于晚期肝癌的病理诊断，或适用于不能明确肝脏占位良恶性的一些疾病。
在早期肝癌的治疗上面，其实大多数临床上是可以明确诊断的，包括手术指征也是很明确的，这一类患者是不建议进行穿刺活检的。因为穿刺活检会使癌细胞发生扩散，使本来早期的肝癌变成了晚期肝癌。所以，临床上是不建议对有明确手术指征的肝癌患者，进行诊断性穿刺的。
但是在临床上也有很多癌症，临床上诊断已经很晚了，但是病理上不太明确，这对于患者的肿瘤用药就带来一定困难，这个时候进行诊断性的穿刺的必要性就非常强。
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