免疫抑制剂由于有抑制机体免疫力的作用，因此，此类药物大多应用于免疫系统异常相关疾病，如肾小球肾炎，类风湿性关节炎，系统性红斑狼疮，干燥综合征，抗磷脂抗体综合征等，上述疾病会根据疾病的严重程度，应用免疫抑制剂或糖皮质激素抑制免疫治疗，避免免疫系统对患者自身正常组织器官造成伤害。
免疫抑制剂的副作用
1、免疫抑制剂近年来被广泛应用于风湿免疫性疾病的治疗，本药物在一定程度上能够改变病程，阻止或延缓病变组织器官的破坏。
2、风湿性疾病常用的免疫抑制剂有三大类分别为抗代谢药， 这些药物可以产生一定的不良反应，常见的有胃肠道反应恶心、呕吐、腹痛、腹泻等，骨髓抑制可出现白细胞以及血小板的减少，另外也可出现肝功能和肾功能的损害，导致血压升高以及过敏反应等等。
3、骨髓抑制，可能发生粒细胞减少或缺乏症。
4、肝功能损害，可以使转氨酶升高。
5、性功能损害，尤其是男性，少数可以发生不育。
6、出血性膀胱炎，从而导致患者血尿增多。
7、产生恶心呕吐、食欲不振等胃肠道反应。
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