亲子鉴定的主要依据是遗传物质的稳定性，在遗传的过程中，亲代和子代之间的遗传物质很大程度上是一致的。亲子鉴定是利用生物学和遗传学的手段提取亲子之间的遗传物质染色体，再根据染色体上ＤＮＡ的核苷酸序列进行比对，当序列的同源性达到一定的高度，即可证明亲代与子代之间的亲缘关系。
一、亲子鉴定怎么做
１、ＤＮＡ提取：对样品进行提取ＤＮＡ，取出蛋白质对提取产物进一步纯化。
２、ＰＣＲ扩增：对提取到的ＤＮＡ按一定的量加入一定的模板，引物，底物等试剂液放入ＰＣＲ仪中进行扩增，使提取的ＤＮＡ浓度增加，便于检测。
３、毛细管测序仪检测：不同大小的DNA片段在电压作用下泳动的速度距离不同，所以在结果中可以看到多条条带，对于符合原本大小的条带进行回收或直接送测序。
4、数据分析，出具结果：检测人员根据结果进行分析汇总，计算，最后出鉴定结果。
二、亲缘关系的鉴定
1、常规的亲生血缘关系鉴定：父母与孩子。
2、隔代亲缘关系鉴定：祖父母与孙子孙女等。
3、疑难的亲缘关系鉴定:叔侄，表兄弟等等。
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