自闭症大脑异常结构主要包括杏仁核萎缩、小脑发育不良、脑脊液增多等。
1、杏仁核萎缩：部分自闭症患者与正常同龄个体大脑内杏仁核大小可能也有所不同。自闭症患者杏仁核通常比正常个体更小，或者部分自闭症患者合并焦虑症情况下才会出现萎缩现象。
2、小脑发育不良：通过颅脑影像学检查可观察到自闭症患者小脑部分脑组织常伴有发育不良迹象。小脑主要协调人体运动功能，它在认知和社交互动中也发挥着作用。
3、脑脊液增多：与正常同龄人相比，部分被诊断出患有自闭症儿童脑脊液会出现明显增多情况，这可能会导致头部异常增大。 自闭症婴幼童脑脊液增多症状通常会持续到3周岁，随后才逐渐趋于平稳。
自闭症大脑异常结构还可能包括海马体萎缩、侧脑室扩大、胼胝体萎缩等。
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