唇腭裂从遗传的角度来讲，普通唇腭裂遗传因素占比是25%，其它因素所导致的唇腭裂是75%。这一代有唇腭裂，下一代不一定会出现显性遗传，但它是隐性遗传遗传，相对父母是唇腭裂的人，下一代产生唇腭裂的几率比正常人要高。
唇腭裂形成的原因除了遗传因素以外，绝大部分是因为环境因素，包括病毒感染、环境因素、营养功能，以及心理因素都可能导致唇裂或腭裂。
随着经济的发展，唇裂、腭裂发病率在逐渐下降，比十年前已经下降了许多，所以遗传因素应该相对比环境因素要小得多。
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