消化道早癌的检查，包括由消化道内镜，也就是最重要的，还有包括血清学的检查和组织学的检查。血清学的检查是最基本的是筛查方式，在食管和结肠，可能没有特异性的血清学指标，在胃，通常通过抗幽门螺杆菌的抗体，以及胃功能三项来进行早期的筛查。筛查出一部分比较高危的人群，来进行内镜学检查，以及后续的组织学的检查，在结肠和食管并没有，特异性的血清学检查的指标。
内镜检查是，筛查消化道早癌最重要的检查方式，消化道早癌，会出现不同时期的腺体的改变，通过内镜的，高清内镜的检查，可以发现腺体的微小的变化，通过微小的变化，取活检，活检检进行组织学的评估。如果组织者发现有个别细胞，以及群体细胞的变异癌变，就可以确诊为消化道早癌。
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