对有益肠道菌群生长的食物以及其他的物质，通常会匿名为益生元。益生元的定义就是有力促进肠道菌群生长，又不被吸收的物质，通常是指多糖，单糖和多糖类的物质，还有部分的是蛋白水解肽。
最常见的益生菌是菊糖，跟葡聚糖还有螺旋藻类这些多糖，这些物质的食物都对益生菌，就是肠道的菌群是有好处的，包括很多的的新鲜的水果、蔬菜，豆制品、奶制品，都含有大量的单糖以及多糖类的物质。这些物质，对于肠道菌群的发展，是有非常大的好处的，对于肠道菌群的维持，也是有非常大的好处。因此多摄入新鲜水果、蔬菜，还有高纤维的物质，还有就是低脂、低盐、低糖，健康的饮食都会有助于肠道菌群的维持。
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